[PX] Scala 最強伝説

「～最強伝説」というと、Opera だったり、黒魔だったり赤魔だったりするわけですが、いずれにしてもその内実は、嫉妬・羨望・侮蔑・自虐が綯い交ぜになったものであるのが常です。

…ま、意味はよくわかりませんが、XDS の出力した XDS_ASCII.HKL を、Scala で処理してみましたよ、ということです。

[PX] MTZ への階段

XDS で拾った回折強度を Scala でスケーリングしてみようかと思います。
そのためには、XDS_ASCII.HKL を マルチレコード MTZ に変換しなければなりません。

今回は、そこらへんをやってみました。

[PX] ( 19 + 1 ) 回目のサンダーボルトII

…タイトル意味不明すぎw

前エントリで試してみた「XDS + xdsme」で、今まで何回も取り上げた波長 1.5 Åでの Thaumatin 結晶のデータを処理してみましょう。

でも、このデータ、実は Unsupported な検出器で取ったんですよね…はたして上手く処理できるんでしょうか？

[PX] xds me to the moon

最初、「xds me tonight」というエントリタイトルにしようかと思ったんですが、ヤメましたｗ

回折強度積分ソフトウェアである『XDS』と、そのヘルパースクリプト『xdsme』を使ってみました。

XDS は、ディテクタ設定や測定条件なんかを全てインプットファイルに書かないといけないので、面倒くさくて敬遠してたんですが、xdsme という python スクリプトを用いることで、そのほとんど全てをイメージファイルのヘッダ情報から抽出し、インプットファイルを自動生成してくれてとても楽チン、と風の噂で聞いたので、やってみることにしました。

評判に違わず、なかなかイイですね、コレ。

[PX] S-SAD について私が知っている二、三の事柄 その3

（承前）

このエントリで（多分）最後です。

[PX] S-SAD について私が知っている二、三の事柄 その2

（承前）

今回は、shelxD のパラメータと結果の評価についてです。

[PX] S-SAD について私が知っている二、三の事柄 その1

タイトルが「ライフハック」系くさくって、生理的にとても気持ち悪いですが、まぁイイでしょうｗ

アクセス解析の結果、PX 関連のエントリを同業者は見ていないことが分かりましたので、以降チラ裏モードで行きます。

S-SAD を行なう上において、不明に思う点として、

1. このタンパク（の結晶）は、S-SAD解析ができるのか？
2. S-SAD解析をおこなうに適した回折データ収集条件（測定波長、冗長度…）は？
3. 得られた回折データを、どのようなパラメータで S-SAD解析するか？

の３点が多いのではないでしょうか。

3. について、解析ソフトウェアに「shelx C/D(/E)」を使った場合に私が経験したことを、ちょっと書いてみます。

…長いですよw